El laboratorio de Microbiología Alimentaria del CNA realiza actividades de análisis de agentes zoonóticos (bacterias, virus y parásitos) transmitidos por los alimentos, dando cumplimiento a la legislación europea y nacional.

Esta unidad colabora con los siguientes Laboratorios de Referencia de la Unión Europea:

• French agency for food, environmental and occupational health & safety (ANSES)
• National Institute for Public Health and the Environment (RIVM)
• Livsmedelseverket. Swedish Food Agency. Suecia
• Istituto Superiore di Sanità (ISS)
• Swedish Veterinary Agency (SVA)
• Technical University of Denmark (DTU)

El alcance de acreditación incluye los siguientes métodos de ensayo:

• Salmonella spp.: Detección en alimentos y muestras ambientales (Norma ISO y método automatizado de PCR) e identificación de cepas
• Listeria monocytogenes: Detección en alimentos y muestras ambientales (Norma ISO), detección en muestras ambientales de superficie (método automatizado de PCR), recuento en placa en alimentos (Norma ISO) e identificación de cepas
• Campylobacter spp.: Detección en alimentos (Norma ISO) e identificación de cepas
• Escherichia coli β-glucuronidasa positiva: Recuento por NMP en moluscos bivalvos (Norma ISO)
• Estafilococos coagulasa positivos: Recuento en alimentos (Normas ISO)
• Trichinella sp.: Detección de larvas en carne (Norma ISO)
• Nematodos de la familia Anisakidae: Detección en pescados y moluscos cefalópodos (Técnicas: por disección y por digestión clorhidropépsica)
• Identificación cualitativa de especies por enzimoinmunoensayo (ELISA sándwich) en carne y productos cárnicos (vacuno, cerdo, oveja y ave) frescos, curados y tratados por calor
• Enterotoxina estafilocócica: Detección en alimentos (Norma ISO)
• Determinación de la susceptibilidad de cepas bacterianas (Escherichia coli y Salmonella spp.) frente a antimicrobianos por un método de microdilución

Además, se dispone de los siguientes métodos no acreditados:

• Detección de E. coli productora de toxina Shiga (STEC) por PCR en tiempo real según Norma ISO
• Identificación molecular de especies de triquina por PCR
• Investigación de brotes de botulismo (detección de Clostridium botulinum y toxinas botulínicas mediante el método de AOAC)
• Detección y determinación cuantitativa de norovirus y virus de la hepatitis A en muestras de productos alimenticios (moluscos bivalvos y frutas blandas, hojas, tallos y bulbos vegetales) y de superficies alimentarias por RT-PCR en tiempo real (Normas ISO)
• Aislamiento de E. coli productora de betalactamasas de espectro ampliado, betalactamasas AmpC o carbapenemasas según protocolo del LR-UE para la resistencia a antimicrobianos. 

De las actividades como laboratorio nacional de referencia cabe destacar:

• La organización anual de ejercicios de intercomparación para la red de laboratorios designados como laboratorios para realizar el Control Oficial

• Participación en la elaboración del “PROCEDIMIENTO PARA LA COORDINACIÓN DE LOS LABORATORIOS DESIGNADOS PARA CONTROL OFICIAL DE TRIQUINA CONFORME AL REGLAMENTO (UE) 2017/625, RELATIVO A LOS CONTROLES OFICIALES Y OTRAS ACTIVIDADES OFICIALES”